Нижняя Дебря — одна из древних улиц Костромы, проходящая вдоль левого берега Волги. Название улица в те времена получила за густые заросли у реки, заросшую лесом низину, чащу.

Воскресенская церковь на Дебре — единственный сохранившийся в Костроме посадский храм XVII века.
В то время в районе Дебри располагались многочисленные кожевенные мастерские. Посадское население решило возвести каменный храм. Самый крупный вклад на его сооружение внёс богатый торговец — кожевенник.

Согласно преданию, среди бочонков краски, поставленных ему из Англии, он обнаружил один не с краской, а с золотыми монетами. Торговец решил использовать их на строительство церкви.

В 1913 году, во время празднования 300-летия Дома Романовых, храм посещал император Николай II с дочерьми и свитой.
В советское время храм оставался действующим до 1930-х годов. Тогда он был закрыт, и в его стенах устроили зернохранилище и военный склад.

В 1946 году храм вновь был открыт.
Более четверти века (с 1964 года) небольшая церковь служила кафедральным собором Костромской епархии. Здесь до 1991 года сохранялась одна из самых почитаемых костромских святынь — Феодоровская икона Божией Матери из разрушенного большевиками в 1934 году Успенского собора Костромского Кремля.
При церкви Воскресения на Дебре в 1993 году был учреждён Знаменский женский монастырь.